Стресс, наследственность и некоторые пищевые продукты, включая шоколад, орехи, томаты, зеленый перец, землянику и цитрусовые, - главные причины афтозного стоматита. Почти также опасны для слизистой рта колючие кусочки чипсов и баранок. Опасно все, что раздражает и ранит нежные ткани. Другие исследования показывают, что появление язв во рту может быть спровоцировано недостаточностью витаминов В6 и В12, фолата, железа или цинка. Изредка прослеживается связь с воспалительными заболеваниями кишечника, такими как колит, целиакия или болезнь Крона.